Berikut ini adalah visi dan misi MTsN 2 Bondowoso :
VISI :
Berjiwa Islami, Berprestasi, Peduli dan Berbudaya Lingkungan
MISI :
1. Menumbuh kembangkan keimanan dan ketaqwaan kepada Allah SWT serta berkarakter yang dijiwai nilai budaya bangsa
2. Meningkatkan prestasi, disiplin dan keterampilan siswa
3. Menyiapkan SDM yang berjiwa islami dan berbudi pekerti luhur
4. Meningkatkan kesadaran dan usaha dalam pelestarian lingkungan yang sehat alami
5. Meningkatkan kepedulian dalam kegiatan pencegahan kerusakan lingkungan
6. Mengupayakan langkah nyata dalam antisipasi mencegah pencemaran lingkungan
